علائم کمبود منگنز برگ ها ابتدا به رنگ سبز روشن (رنگ پریده) درآمده و کم‌کم قسمت های تیره‌رنگی در امتداد رگبرگ ها تشکیل می شوند. بدین ترتیب تشخیص این کمبود با کمبود منیزیم بسیار مشکل است و گاهاً اشتباه می‌گردد ولی در صورت ادامه روند کمبود برگ‌ها شده و لبه‌ها از بین می‌روند ضمن این که برگ های پیرتر زودتر تحت تاثیر قرار می‌گیرند برای جبران کمبود می‌توان از محلول سولفات منگنز 5 در هزار به میزان 1000 لیتر برای هر هکتار استفاده نمود. یکی از علت های اصلی عدم جذب این عنصر PH بالای خاک است که بعضاً اتفاق می‌افتد در کشت های با بستر هیدرویونیک میتوان محلول تغذیه را اصلاح نمود. این کمبود در بستر های پیتی بیش از خاک‌های شنی لومی اتفاق می‌افتد.